兩當縣林木資源豐富，有白皮松、紅豆杉、鐵杉、銀杏、香樟、合歡等珍稀樹種42個，尤以白皮松、紅豆杉資源較為豐富。目前全縣分布有7.7萬畝白皮松，其中靈官峽內分布面積達4.4萬畝，經中國林科院洪濤教授考證，靈官峽白皮松是國內分布面積最大、也是世界上罕見的白皮松純林區。為了加快白皮松的開發利用，近兩年，縣林業部門繁育優質白皮松苗木150萬株，在全縣推廣栽植白皮松200畝、62萬株。被譽為植物“活化石”的紅豆杉在兩當縣境內分布約4.5萬畝、35萬余株，紅豆杉含有抗癌物質紫杉醇。為了充分開發利用紅豆杉獨特的資源，縣上通過上門招商，引進浙江臺州客商，組建甘肅秦嶺生物科技有限公司，對該縣紅豆杉資源進行繁育開發，目前該公司已投資600萬元，在金洞鄉樺林村王家山栽植曼地亞紅豆杉3000余畝、40萬株。