清華大學城市規劃研究所的發展經歷了四個階段。

　　第一個臺階：草創時代

　　1984年吳良鏞先生創辦清華大學建筑與城市研究所，主持國家教委博士點基金項目“我國城市結構形態發展規律的研究”（198-1987）。

　　1981年-1995年研究所開展了北京亞運會和奧林匹克建設研究，在“時間計劃、空間規劃”內容外，增加了“經濟時空”概念（即利用經濟控制論的概念將建筑時空觀和經濟時空觀綜合研究），力求使建設以最少的投資取得最大的建設效果。這項研究的結構得到國家決策層的肯定，將大大節約了建設預算內的經費投入。研究成果獲得國家教委1987年科技進步一等獎。

　　第二個臺階：開創新局面

　　1980年代，吳良鏞先生運用融貫的綜合研究方法，從聚居、地區、文化等范圍和層次上，對建筑學及其相關方面進行整體的綜合研究，建立了有中國特色的建筑學理論體系。1989年《廣義建筑學》出版，1990年獲國家教委科技進步一等獎，為研究所的科學研究初步奠定了學術基礎，并打開了新局面。吳良鏞先生同時獲得：

　　1990年 對中國教育事業特殊貢獻榮譽證書，國家教委；

　　1989年 對人類藝術遺產特殊貢獻榮譽證書，國際文化理事會；

　　1989年 中國科學進步特殊貢獻榮譽證書，中國科學院；

　　1988年 桂林中心區詳細規劃（集體合作）獲全國規劃設計三等獎，建設部。

　　第三個臺階：走向國際

　　以1992-1993年菊兒胡同獲得世界人居獎、與加拿大CEDA合作的“亞洲城市合作網——中國人居環境”研究項目為代表的工作，標志著研究所的工作走向國際平臺，對研究所繼續前進給予了極大地鼓勵和鞭策。

　　1980年代開始、1992年完成第二階段工作的北京菊兒胡同危房整修與新四合院工程，探索舊城有機更新之路，“開創了北京城市中心區進行更新的一種新途徑，傳統四合院住宅格局得到保留并加以改進，避免了全部拆除舊城內歷史性衰敗住宅。同樣重要的是，這個工程還探索了一種歷史城市中住宅建設集資和規劃的新途徑”（引自“1992年世界人居獎”評語）。工程榮獲多項國內大獎并得到國際學術屆的高度重視，1992年亞洲建筑師協會為其頒發金質獎章，1993年在聯合國總部接受由當屆聯大主席頒發的“世界人居獎”。

　　1999年世界建筑師大會在北京舉辦，大會通過吳良鏞教授負責起草的《北京憲章》。《北京憲章》引導建筑師全方位地認識人居環境的方法論，而不是局限在狹隘的技術-美術范圍內；融合建筑、地景與城市規劃；包含新建、運營、維修乃至更新的建筑過程；植根于地方與社會、直至覆蓋心理范疇的多層次技術體系；將美術、工藝以及工業設計與建筑師的工作結合起來；視社會整體為最高業主的職業倫理；對專業人員、業主、直至全民實施開放的、連貫的建筑教育。

　　第四個臺階：攀登科學高峰

　　進入新世紀，研究所以《北京憲章》時開始的大北京研究為基礎，努力推動京津冀空間規劃的研究，在各級政府領導和多個領域專家學者的支持下，完成了《京津冀城鄉空間規劃研究報告》。這是進入新世紀對京津冀區域發展的最早研究，成果得到社會各界的重視。北京、天津市政府由此請研究所團隊開展北京、天津城市空間發展戰略研究，參加北京城市總體規劃修編，并以此為基礎，完成了國家自然科學基金重點項目：“中國人居理論基本理論和典型范例”。

　　人居環境科學的工作得到了清華大學的重視，列為建筑學院學科發展的基礎，并以此為核心，由教育部提名申請“國家最高科技獎”。雖然申請沒有成功，說明我們仍存在差距，但應當視為對我們的鞭策，給我們提出了更高的要求，即肩負時代重任，攀登科學高峰。