北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院林忠平教授在植物基因工程研究中，注重生物技術(shù)應(yīng)用的安全問題。他認(rèn)為，生物技術(shù)的利用，要有利于生物多樣性的保護(hù)，只有保護(hù)基因資源的多樣性，才能保護(hù)生態(tài)環(huán)境。
保護(hù)生態(tài)環(huán)境是植物生物技術(shù)的重要課題。北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院林忠平教授領(lǐng)導(dǎo)的農(nóng)業(yè)分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室，在植物對(duì)逆境脅迫的抗性基因工程、植物生物反應(yīng)器生產(chǎn)藥用蛋白、植物次生代謝的基因調(diào)控、轉(zhuǎn)基因食品的致敏性評(píng)估等方面，研究取得了諸多成果，其中一些成果具重要和潛在的應(yīng)用價(jià)值。
早年畢業(yè)于北京大學(xué)生物系并考取中國(guó)科學(xué)院植物研究所研究生的林忠平，長(zhǎng)期從事細(xì)胞生物學(xué)和分子生物學(xué)研究。曾任課題組組長(zhǎng)、基因工程中心主任。1995年調(diào)入北京大學(xué)蛋白質(zhì)工程及植物基因工程國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，主攻分子生物學(xué)和植物基因工程研究。
林忠平教授早期研究植物分子生物學(xué)，最成功的是靈芝人工培養(yǎng)技術(shù)和藥效，著有《靈芝》一書，并推動(dòng)這一傳統(tǒng)藥物的應(yīng)用。他積極承擔(dān)國(guó)家973、863高技術(shù)研究計(jì)劃生物技術(shù)領(lǐng)域中的課題和國(guó)家重要科研項(xiàng)目，榮獲兩項(xiàng)省部級(jí)科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)和多項(xiàng)其它獎(jiǎng)，還有多項(xiàng)科研成果通過省部級(jí)成果鑒定。為使科研成果轉(zhuǎn)化成生產(chǎn)力，他在教育部和學(xué)校的安排下，多次到開展對(duì)口支援的新疆推廣生物技術(shù)的實(shí)際應(yīng)用。他領(lǐng)導(dǎo)的實(shí)驗(yàn)室還同一些農(nóng)林業(yè)產(chǎn)業(yè)公司建立了長(zhǎng)期良好的合作關(guān)系。他經(jīng)常開展青少年科普工作，還指導(dǎo)殘疾學(xué)生學(xué)習(xí)高端的生物技術(shù)。
目前，他所領(lǐng)導(dǎo)的北大農(nóng)業(yè)分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室，在提高植物對(duì)逆境脅迫的抗性方面，開展了克隆耐旱、耐寒相關(guān)基因，提高植物對(duì)不良環(huán)境的抵抗力的研究。將某些基因?qū)氩萜翰荨⒚藁ā⒂衩锥家勋@得成效。他還在新疆、東北等旱區(qū)和高寒地區(qū)拓展農(nóng)業(yè)生物技術(shù)應(yīng)用。在探索植物與環(huán)境之間復(fù)雜關(guān)系中，發(fā)現(xiàn)植物和內(nèi)生菌基因組之間的信息交流對(duì)于植物的抗逆性是十分重要的。這方面的研究對(duì)于促進(jìn)植物對(duì)環(huán)境的適應(yīng)有很大幫助。
林忠平教授從事植物基因工程研究多年。他認(rèn)為，基因是演化過來(lái)的，基因在變化之中。在生物系統(tǒng)發(fā)育和個(gè)體發(fā)育中基因是變化著的。在一個(gè)種群中，不同個(gè)體的基因也是有差異的。人類對(duì)基因變化的干預(yù)不是從基因工程的應(yīng)用才開始的。他不贊成過分渲染基因工程的危害，而反對(duì)基因技術(shù)的應(yīng)用。他強(qiáng)調(diào)生物的多樣性是非常珍貴的資源要大力保護(hù)，認(rèn)為環(huán)境保護(hù)重要著力點(diǎn)應(yīng)是生物多樣性的保護(hù)。他認(rèn)為，人口劇增和城市化發(fā)展加速的今天，對(duì)生物多樣性的保護(hù)尤為重要。生物多樣性不僅保護(hù)了基因資源的多樣性，也保護(hù)了生態(tài)環(huán)境的健康發(fā)展。生物安全性研究不應(yīng)局限于轉(zhuǎn)基因作物的安全性研究。人類的農(nóng)業(yè)歷史就是生物資源和基因資源利用的歷史。人改變了許多動(dòng)植物的基因，改變了它們的遺傳特性。人類的發(fā)展和經(jīng)濟(jì)的提升必然涉及人對(duì)于生物物種的改良。林教授利用基因操作技術(shù)控制某些植物的代謝途徑，促進(jìn)某些植物的器官積累對(duì)人有用的成分，例如大豆異黃酮、白藜蘆醇這些對(duì)人有保健價(jià)值的成分。他還利用植物和某些真菌作為一種生物反應(yīng)器，用來(lái)生產(chǎn)某些藥用多肽。其中包括人的胰島素、免疫調(diào)節(jié)蛋白。目前已有一些動(dòng)物試驗(yàn)的結(jié)果證明植物和真菌反應(yīng)器的產(chǎn)物有著很好的應(yīng)用潛力。
林忠平教授十分注重生物技術(shù)應(yīng)用中的安全問題。他認(rèn)為，高新技術(shù)的應(yīng)用一定要有利于生物多樣性的保護(hù)，在做遺傳改良的時(shí)候，還要考慮人類食品的安全。在科技部973項(xiàng)目的資助下，他的實(shí)驗(yàn)室在生物技術(shù)安全性研究方面，出色地完成了關(guān)于轉(zhuǎn)基因作物潛在的致敏性的研究。這項(xiàng)研究就是考慮到某些人群對(duì)某類食品會(huì)產(chǎn)生過敏。他認(rèn)為，做基因轉(zhuǎn)移時(shí)就要考慮新轉(zhuǎn)入的基因會(huì)不會(huì)導(dǎo)致植物中新的蛋白成分可能引發(fā)的致敏性，還要對(duì)轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品中新的致敏性的變化作出評(píng)估。林忠平還主張利用生物技術(shù)，包括用轉(zhuǎn)基因技術(shù)來(lái)進(jìn)行環(huán)境的凈化。利用高新生物技術(shù)可以創(chuàng)造新的綠色環(huán)境。他舉例說(shuō)，他的實(shí)驗(yàn)室利用轉(zhuǎn)基因技術(shù)可使植物耐受低氧的環(huán)境，從而提高了凈化環(huán)境的能力。他認(rèn)為，利用生物處理污水、污泥是應(yīng)當(dāng)著力發(fā)展的。
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